知网查重会留底的主要原因在于保障学术诚信和学术质量。知网作为国内权威的学术资源平台，对于学术论文的查重工作十分重视。通过留底，可以有效防止学术不端行为，确保学术成果的真实性和可信度。此举也有助于提高学术界的整体水平，促进学术交流与合作。同时，留底还可以为学术研究提供便利，避免重复劳动，提升学术研究的效率。

另外，知网查重留底还有助于学术成果的追溯和引用。通过留底，可以方便学者查找和引用相关文献，促进学术研究的持续发展。同时，留底也为学术机构和评审部门提供了依据，便于对学术成果的评估和审核。总的来说，知网查重留底的做法是为了维护学术界的正常秩序，促进学术研究的良性发展。